A、ICD-9-CM-3每年进行修订与补充，更新及时；ICPM自1978年至今未修订

B、ICD-9-CM-3是ICPM两卷书的合订本，只有一个类目表和一个字母索引表

C、ICD-9-CM-3分类结构以解剖部位为主；ICPM将所有的活组织病理检查单独列出，归入第一章

D、ICD-9-CM-3分类类目是以两位数为基础，ICPM是三位数，加上章号四位数才能与其他操作编码区分开

E、ICPM除手术外，其余各章都以手术操作方式为轴心；ICD-9-CM-3认为ICPM的分类轴心不利于临床使用，把分散的操作归到解剖部位之下